Riigisisest ühistransporti korraldab ja rahvusvaheliste bussiliinide liinilubasid menetleb regionaal- ja põllumajandusministeerium.
Rahvusvahelise ühistranspordi korraldamisega tegeleb kliimaministeerium.
Ühistransport
Ühistransporti osutatakse taksoveo, juhuveo või liiniveo korras ja selle võib liigitada neljaks valdkonnaks, mida korraldavad erinevad asutused.
Kohalikku ühistransporti korraldab kohalik omavalitsus. Suurimad liinivõrgud on Tallinnas ja Tartus. Maakohtade omavalitsustes kasutatakse kohalikku ühistransporti eelkõige õpilaste sõidutamiseks või sotsiaalteenuste kättesaadavuse tagamiseks.
Regionaalset ühistransporti korraldab riik koos maavalitsuste või kohalike omavalitsustega ühistranspordikeskuste kaudu. Regionaalse ühistranspordi eesmärk on tagada ühendus kõige olulisema tõmbekeskusega, et inimesed saaksid seal tööl ja koolis käia ning pääseksid ligi sotsiaalteenustele.
Üleriigiline ühistransport toimib kommertsalustel, mis ühendab eelkõige tõmbekeskuseid. Liinivõrk kujuneb vastavalt vedajate esitatud taotlustele, mida menetleb regionaal- ja põllumajandusministeeriumi ühistranspordiosakond.
Taksovedu on sõitjate vedu tellija soovitud sihtkohta või sõitjale tellitud kohta järele sõitmine taksoveoks kohandatud sõidukiga. Taksovedu korraldab kohalik omavalitsus, kes väljastab taksoveolube ja taksoveo sõidukikaarte.
Juhuveo sõitjaid veetakse tellija või vedaja enda algatusel. Juhu- ja liiniveoks peab vedajal olema Euroliidu tegevusluba ning iga sõiduki kohta Euroopa Liidu tegevusloa tõendatud koopia.
Ühistranspordiliinide info
Ühistranspordi kasutajad leiavad reisi planeerimise jaoks kasulikku infot portaalist Peatus.ee. Portaalist leiab peaaegu kõik Eesti-sisesed sõiduplaani alusel sõitvad ühistranspordiliinid. Reisi on võimalik planeerida, kasutades selleks maakonna bussi-, linna- ja rongiliine.