Esimene samm organisatsiooni keskkonnajuhtimissüsteemi rakendamisel on esmane keskkonnaülevaatus. Selle käigus hinnatakse organisatsiooni keskkonnategevust ja selle taset. Samuti tuleb kindlaks määrata peamised rollid ja kontaktisikud, organisatsiooni registreeriv tegevuskoht või tegevuskohad ning registreeringu ulatus. Samuti tuleb kindlustada juhtkonnapoolne pühendumus.

Lisaks tuleb määratleda toimingutest ja teenustest tulenevad otsesed ja kaudsed keskkonnaaspektid ning hinnata nende mõju keskkonnale. Keskkonnaülevaatuse käigus kogutud info (eelkõige olulisemate keskkonnaaspektide ülevaade) on EMASi rakendamise aluseks.