Прежде чем впервые подавать декларацию о доходах, необходимо определить, являетесь ли вы резидентом Эстонии, или нет.  Если вы не знаете, являетесь ли вы резидентом или нерезидентом, это можно проверить на сайте EMTA. Если вы не являетесь налоговым резидентом Эстонии, но условия для получения статуса налогового резидента соблюдены, необходимо подать заявление об определении резидентства в Налогово-таможенный департамент, что удобнее всего сделать в среде электронных услуг e-MTA Налогово-таможенного департамента.
См. также: Другие способы подачи заявления об определении резидентства.

Если вы являетесь резидентом Эстонии, в декларации о доходах необходимо указывать доходы, полученные как в Эстонии, так и в других странах. Нерезидентам обычно не нужно подавать декларацию о доходах, так как подоходный налог удерживает тот, кто совершает выплату. Нерезидент обязан декларировать доход, если он получил в Эстонии доход от продажи имущества, арендную плату от физического лица или доход от предпринимательской деятельности. В порядке исключения резиденты стран, входящих в Европейскую экономическую зону, желающие получить вычеты из своего налогооблагаемого дохода, полученного в Эстонии, должны задекларировать в Эстонии доход, полученный по всему миру. Наиболее удобным способом подачи декларации о доходах является электронная среда Налогово-таможенного департамента e-MTA. Чтобы войти в E-MTA, необходимо иметь ID-карту (например, карту вида на жительство), mobiil-ID, Smart ID или e-ID страны ЕС. Подача деклараций о доходах начинается 15 февраля и продолжается до 30 апреля.