Ребёнку, родившемуся в Эстонии, присваивает идентификационный код медицинское учреждение, оказавшее акушерскую помощь при родах. После внесения данных ребёнка в медицинское свидетельство о рождении они передаются в регистр населения. Затем законный представитель ребёнка может подать заявление о регистрации рождения в Департамент записи актов гражданского состояния.