Igas kaitseväe struktuuriüksuses tegutsevad meditsiinikeskused. Selline süsteem tagab kõikidele ajateenijatele esmatasandi arstiabi. Üldarstiabi ja hambaravi osutamiseks on meditsiinikeskustes professionaalsed tervishoiutöötajad ning nõuetekohase sisustuse ja varustusega ruumid. Kaitseväe logistikakeskuse tervisekeskuses saavad ajateenijad lisaks üldarstiabile ka piiratud mahus haiglavälist eriarstiabi.


Lisaks on kaitseväel olemas oma kaplanid, psühholoogid ja sotsiaaltöötajad, kes toetavad ja abistavad teenistuses hakkamasaamisel.