Keskkonnakava on EMAS keskkonnajuhtimissüsteemi rakendamisel väga oluline samm. Selles etapis määratakse kindlaks organisatsiooni keskkonnaeesmärgid ja -ülesanded ning kavandatakse meetmed, mis aitavad parandada keskkonnatoimet ja viia ellu keskkonnapoliitika põhimõtteid. Keskkonnakava põhineb keskkonnaülevaate tulemustel ning aitab suunata igapäevast tööd ja pidevat parendamist. Keskkonnakava on konkreetne tegevusplaan keskkonnapoliitika elluviimiseks.