После успешного прохождения верификационного аудита организация может подать заявку на регистрацию в EMAS вместе с требуемыми документами в компетентный орган. В ходе регистрации проверяется правильность и соответствие документов, и в случае положительного решения организации выдаются свидетельство EMAS и регистрационный номер.